Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPFP49454 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPFP49454 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPFP49454 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPFP49454 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPFP49454 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPFP49454 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPFP49454 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPFP49454 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPFP49454 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPFP49454 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPFP49454 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms