Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NESP48681 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NESP48681 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NESP48681 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NESP48681 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NESP48681 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NESP48681 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NESP48681 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NESP48681 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NESP48681 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NESP48681 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NESP48681 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NESP48681 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NESP48681 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NESP48681 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NESP48681 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NESP48681 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NESP48681 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 Z84721.1-201ENST00000438841 372 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NESP48681 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NESP48681 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms