Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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ITGA3P26006 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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ITGA3P26006 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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ITGA3P26006 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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ITGA3P26006 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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ITGA3P26006 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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ITGA3P26006 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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