Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AL096817.1-201ENST00000623904 1775 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 TRIAP1-202ENST00000546954 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
VAMP1P23763 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms