Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEBLO76041 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms