Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms