Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RFPL4BQ6ZWI9 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RFPL4BQ6ZWI9 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RFPL4BQ6ZWI9 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RFPL4BQ6ZWI9 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RFPL4BQ6ZWI9 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RFPL4BQ6ZWI9 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RFPL4BQ6ZWI9 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RFPL4BQ6ZWI9 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RFPL4BQ6ZWI9 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RFPL4BQ6ZWI9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RFPL4BQ6ZWI9 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RFPL4BQ6ZWI9 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RFPL4BQ6ZWI9 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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RFPL4BQ6ZWI9 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RFPL4BQ6ZWI9 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RFPL4BQ6ZWI9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RFPL4BQ6ZWI9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RFPL4BQ6ZWI9 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RFPL4BQ6ZWI9 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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