Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms