Protein–RNA interactions for Protein: Q16513

PKN2, Serine/threonine-protein kinase N2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN2Q16513 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKN2Q16513 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms