Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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