Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TSTA3Q13630 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms