Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms