Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PPARDQ03181 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARDQ03181 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms