Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN1P49257 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms