Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms