Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC8A1P32418 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms