Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCR1P32246 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCR1P32246 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCR1P32246 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCR1P32246 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCR1P32246 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCR1P32246 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCR1P32246 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCR1P32246 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCR1P32246 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCR1P32246 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCR1P32246 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCR1P32246 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCR1P32246 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCR1P32246 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCR1P32246 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCR1P32246 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCR1P32246 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCR1P32246 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCR1P32246 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCR1P32246 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCR1P32246 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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