Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFNP31947 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms