Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms