Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms