Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARF4P18085 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF4P18085 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF4P18085 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF4P18085 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF4P18085 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF4P18085 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF4P18085 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF4P18085 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF4P18085 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF4P18085 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF4P18085 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF4P18085 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF4P18085 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF4P18085 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF4P18085 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF4P18085 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF4P18085 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF4P18085 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.6 ms