Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms