Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCDHB4Q9Y5E5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms