Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms