Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMKLBQ9ULI2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMKLBQ9ULI2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms