Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CFDP1Q9UEE9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CFDP1Q9UEE9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CFDP1Q9UEE9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms