Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNAL1Q9UBT7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.8 ms