Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGAP28Q9P2N2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms