Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CWC15Q9P013 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CWC15Q9P013 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CWC15Q9P013 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CWC15Q9P013 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CWC15Q9P013 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CWC15Q9P013 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms