Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MSRB1Q9NZV6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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