Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDE1Q9NZC3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
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