Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTMR4Q9NYA4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MTMR4Q9NYA4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms