Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms