Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX58

LYAR, Cell growth-regulating nucleolar protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYARQ9NX58 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LYARQ9NX58 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms