Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB20Q9NX57 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms