Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COMMD8Q9NX08 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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