Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCND1Q9NSA2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms