Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.221e-7■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.11e-7■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.621e-7■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.591e-7■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.131e-7■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 GNB2-211ENST00000469287 1702 ntTSL 215.63■□□□□ 0.091e-7■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 SSR4-209ENST00000482902 2409 ntTSL 217.22■□□□□ 0.358e-7■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.358e-7■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.348e-7■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 SSR4-208ENST00000471880 785 ntTSL 516.14■□□□□ 0.178e-7■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.128e-7■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.038e-7■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 SSR4-206ENST00000460616 2482 ntTSL 214.4□□□□□ -0.18e-7■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 SSR4-211ENST00000486204 658 ntTSL 313.9□□□□□ -0.188e-7■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 SSR4-205ENST00000447375 427 ntTSL 213.63□□□□□ -0.238e-7■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 SSR4-210ENST00000485612 701 ntTSL 213.63□□□□□ -0.238e-7■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPL21-210ENST00000493317 438 ntTSL 21.72□□□□□ -2.131e-16■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.474e-16■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.054e-16■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.054e-16■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.934e-16■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.424e-16■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.264e-16■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.034e-16■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.934e-16■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.684e-16■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 MAZ-209ENST00000565777 1313 ntTSL 217.89■□□□□ 0.454e-16■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 MAZ-213ENST00000568411 599 ntTSL 317.18■□□□□ 0.344e-16■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 MDK-209ENST00000489525 1339 ntTSL 526.24■■□□□ 1.799e-17■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.769e-17■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.719e-17■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.649e-17■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.289e-17■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.239e-17■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.19e-17■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.99e-17■□□□□ 11.2
APOBEC3CQ9NRW3 FUS-209ENST00000566605 1787 ntTSL 1 (best)26.32■■□□□ 1.88e-8■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.688e-8■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.448e-8■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.058e-8■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 FUS-206ENST00000487509 4920 ntTSL 213.27□□□□□ -0.288e-8■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS19-207ENST00000600467 420 ntTSL 222.97■■□□□ 1.274e-66■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS19-205ENST00000598466 601 ntTSL 212.49□□□□□ -0.414e-66■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS19-208ENST00000601492 342 ntTSL 59.12□□□□□ -0.954e-66■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPL9-204ENST00000503040 571 ntTSL 43.45□□□□□ -1.861e-13■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3G-207ENST00000589009 1522 ntTSL 216.47■□□□□ 0.233e-8■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.23e-8■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3G-212ENST00000592485 893 ntTSL 215.48■□□□□ 0.073e-8■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3G-206ENST00000588709 828 ntTSL 514.67□□□□□ -0.063e-8■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3G-202ENST00000587146 709 ntTSL 514.31□□□□□ -0.123e-8■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3G-214ENST00000593066 590 ntTSL 513.19□□□□□ -0.33e-8■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3G-215ENST00000593095 636 ntTSL 312.08□□□□□ -0.483e-8■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3G-211ENST00000590940 762 ntTSL 312.03□□□□□ -0.483e-8■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3G-205ENST00000587993 555 ntTSL 312.02□□□□□ -0.493e-8■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3G-203ENST00000587168 352 ntTSL 412.02□□□□□ -0.493e-8■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3G-208ENST00000589454 873 ntTSL 511.88□□□□□ -0.513e-8■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3G-204ENST00000587681 537 ntTSL 28.86□□□□□ -0.993e-8■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.545e-11■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 CKB-207ENST00000554282 735 ntTSL 222.52■■□□□ 1.25e-11■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 CKB-204ENST00000553652 1239 ntTSL 518.78■□□□□ 0.65e-11■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 CKB-202ENST00000553528 1170 ntTSL 218.51■□□□□ 0.555e-11■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 CKB-210ENST00000554989 625 ntTSL 217.11■□□□□ 0.335e-11■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.744e-9■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.354e-9■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.044e-9■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 SSBP1-206ENST00000467681 630 ntTSL 214.73□□□□□ -0.054e-9■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 SSBP1-210ENST00000481508 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.594e-9■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 SSBP1-208ENST00000469123 662 ntTSL 59.3□□□□□ -0.924e-9■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.34e-9■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 SSBP1-204ENST00000465167 517 ntTSL 56.38□□□□□ -1.394e-9■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.74e-9■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.195e-7■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.015e-7■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.265e-7■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.225e-7■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.165e-7■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.165e-7■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 NME2-208ENST00000570801 565 ntTSL 214.06□□□□□ -0.165e-7■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 NME2-209ENST00000573262 789 ntTSL 1 (best)10.69□□□□□ -0.75e-7■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 GSTP1-203ENST00000467591 736 ntTSL 212.52□□□□□ -0.413e-17■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 UQCRC1-207ENST00000471189 955 ntTSL 314.49□□□□□ -0.094e-6■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 ERH-201ENST00000216520 668 ntTSL 316.45■□□□□ 0.222e-8■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.162e-8■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.719e-10■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.139e-10■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 AK2-207ENST00000482191 599 ntTSL 214.06□□□□□ -0.169e-10■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 AK2-209ENST00000491241 596 ntTSL 311.93□□□□□ -0.59e-10■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5B-208ENST00000551182 457 ntTSL 27.42□□□□□ -1.224e-41■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 AAMP-210ENST00000494720 1134 ntTSL 224.36■■□□□ 1.493e-8■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.173e-8■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 AAMP-209ENST00000489767 1833 ntTSL 515.8■□□□□ 0.123e-8■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.083e-8■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 AAMP-208ENST00000475678 2270 ntTSL 215.04■□□□□ -03e-8■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.053e-8■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.091e-8■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.385e-7■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.225e-7■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 COX6A1-202ENST00000549525 767 nt6.95□□□□□ -1.35e-7■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 SLC37A3-210ENST00000469193 647 ntTSL 324.67■■□□□ 1.541e-323■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 SLC37A3-204ENST00000460560 2111 ntTSL 519.68■□□□□ 0.741e-323■□□□□ 11
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