Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PRDM7Q9NQW5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms