Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms