Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF2Q9HAK2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF2Q9HAK2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms