Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LHX5Q9H2C1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX5Q9H2C1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms