Protein–RNA interactions for Protein: Q9H269

VPS16, Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS16Q9H269 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS16Q9H269 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS16Q9H269 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS16Q9H269 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS16Q9H269 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS16Q9H269 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms