Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H12CQ9C0D7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms