Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRCC1Q9C099 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms