Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD6Q9BRQ6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD6Q9BRQ6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms