Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.179e-7■■■■■ 29
BUD13Q9BRD0 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.29e-7■■■■■ 29
BUD13Q9BRD0 NF1-215ENST00000493220 5691 ntTSL 26.56□□□□□ -1.369e-7■■■■■ 29
BUD13Q9BRD0 NF1-205ENST00000456735 7787 ntTSL 56.33□□□□□ -1.49e-7■■■■■ 29
BUD13Q9BRD0 NF1-216ENST00000495910 8223 ntTSL 25.55□□□□□ -1.529e-7■■■■■ 29
BUD13Q9BRD0 NF1-219ENST00000579081 8788 ntTSL 1 (best)5.45□□□□□ -1.549e-7■■■■■ 29
BUD13Q9BRD0 RNF216-208ENST00000479541 580 ntTSL 47.01□□□□□ -1.293e-10■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.222e-8■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 IGHMBP2-208ENST00000544521 1683 ntTSL 1 (best)19.97■□□□□ 0.796e-6■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.764e-11■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 TBL3-204ENST00000567615 1047 ntTSL 219.63■□□□□ 0.736e-6■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 ACVR2B-203ENST00000465020 1666 ntTSL 219.01■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.594e-11■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 HACE1-204ENST00000416605 4729 ntTSL 1 (best)18.48■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.464e-11■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.414e-11■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 TAB1-205ENST00000473613 534 ntTSL 417.02■□□□□ 0.324e-11■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 LPIN1-214ENST00000475286 192 ntTSL 316.79■□□□□ 0.284e-11■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 ERBB2-213ENST00000582818 529 ntTSL 316.49■□□□□ 0.234e-11■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 TBL3-207ENST00000569792 856 ntTSL 516.4■□□□□ 0.224e-6■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.154e-11■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 LSM14A-205ENST00000586157 944 ntTSL 515.88■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -02e-8■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.026e-6■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.042e-8■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 ACVR2B-202ENST00000461232 5370 ntTSL 1 (best)14.48□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.246e-6■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 IGHMBP2-207ENST00000543739 2846 ntTSL 213.54□□□□□ -0.246e-6■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 TAB1-207ENST00000490819 240 ntTSL 213.05□□□□□ -0.324e-11■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 IGHMBP2-201ENST00000255078 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.396e-6■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 ITPR1-219ENST00000544951 4131 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.426e-6■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 ACVR2B-201ENST00000352511 11821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 LSM14A-206ENST00000588582 3601 ntTSL 211.33□□□□□ -0.62e-8■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.615e-21■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 NUP214-204ENST00000453861 3208 ntTSL 510.95□□□□□ -0.664e-10■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 PHB-212ENST00000512041 694 ntTSL 310.84□□□□□ -0.674e-11■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 PHB-205ENST00000446735 732 ntTSL 510.44□□□□□ -0.744e-11■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 LPIN1-211ENST00000460096 629 ntTSL 1 (best)9.6□□□□□ -0.874e-11■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 NEMF-215ENST00000557380 1742 ntTSL 1 (best)9.2□□□□□ -0.944e-11■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 KIF2C-206ENST00000472235 480 ntTSL 28.52□□□□□ -1.054e-11■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.056e-6■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.066e-6■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.076e-6■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.146e-6■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.375e-21■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 EIF5-206ENST00000558551 744 ntTSL 25.97□□□□□ -1.454e-11■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 SH3D21-201ENST00000453908 2408 ntAPPRIS P1 TSL 523.06■■□□□ 1.288e-9■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.058e-9■■■■■ 28.9
BUD13Q9BRD0 IRAK2-201ENST00000256458 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 28.8
BUD13Q9BRD0 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.043e-14■■■■■ 28.8
BUD13Q9BRD0 HNRNPH1-210ENST00000504549 980 ntTSL 519.17■□□□□ 0.661e-22■■■■■ 28.8
BUD13Q9BRD0 HNRNPH1-247ENST00000523921 584 ntTSL 212.98□□□□□ -0.331e-22■■■■■ 28.8
BUD13Q9BRD0 HNRNPH1-239ENST00000521173 831 ntTSL 512.03□□□□□ -0.481e-22■■■■■ 28.8
BUD13Q9BRD0 GRHL1-204ENST00000464418 2099 ntTSL 213.85□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 GRHL1-205ENST00000472167 2060 ntTSL 1 (best)9.77□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 GRHL1-201ENST00000324907 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 MED15-224ENST00000476767 590 ntTSL 418.69■□□□□ 0.581e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.634e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.494e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 POLRMT-205ENST00000590573 1043 ntTSL 321.71■■□□□ 1.074e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.954e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.914e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.834e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 POLRMT-206ENST00000590709 1106 ntTSL 219.42■□□□□ 0.74e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.634e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.54e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.474e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.474e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.464e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 BCL2L12-207ENST00000598979 893 ntTSL 317.63■□□□□ 0.414e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 SSB-204ENST00000417292 545 ntTSL 316.74■□□□□ 0.274e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.174e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 BCL2L12-205ENST00000594793 311 ntTSL 315.42■□□□□ 0.064e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.024e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 SSB-203ENST00000413002 674 ntTSL 314.95□□□□□ -0.024e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.084e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 AKNA-209ENST00000492875 3894 ntTSL 214.13□□□□□ -0.154e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 NPC1-202ENST00000540608 2790 ntTSL 213.44□□□□□ -0.264e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 BCL2L12-213ENST00000619007 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.294e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 NPC1-210ENST00000591051 3171 ntTSL 210□□□□□ -0.814e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 SSB-205ENST00000422006 2463 ntTSL 59.68□□□□□ -0.864e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 SSB-210ENST00000474273 735 ntTSL 26.79□□□□□ -1.324e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 SSB-208ENST00000468600 290 ntTSL 25.58□□□□□ -1.524e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 REXO1-203ENST00000586343 718 ntTSL 513.91□□□□□ -0.185e-8■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 DDIT4-203ENST00000473155 753 ntTSL 1 (best)24.27■■□□□ 1.484e-13■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.144e-13■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.643e-9■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 CDK2-209ENST00000556146 911 ntTSL 311.21□□□□□ -0.618e-13■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 CDK2-212ENST00000556656 1136 ntTSL 310.95□□□□□ -0.668e-13■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 CDK2-210ENST00000556276 665 ntTSL 58.54□□□□□ -1.048e-13■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 EDC4-212ENST00000576972 747 ntTSL 317.79■□□□□ 0.447e-10■■■■■ 28.7
BUD13Q9BRD0 SLBP-203ENST00000480936 558 ntTSL 427.71■■■□□ 2.033e-13■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.583e-13■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.733e-13■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.643e-13■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.573e-13■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SLBP-204ENST00000483348 1030 ntTSL 318.46■□□□□ 0.553e-13■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SPATA20-212ENST00000505559 1590 ntTSL 225.14■■□□□ 1.626e-8■■■■■ 28.6
Retrieved 100 of 53,381 protein–RNA pairs in 672 ms