Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms