Protein–RNA interactions for Protein: Q99748

NRTN, Neurturin, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRTNQ99748 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRTNQ99748 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NRTNQ99748 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms