Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC22AQ96IW7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms